Перейти к основному содержанию

Единица хранения коллекции

Каталожный номер: Z-0531
Название единицы хранения: Z-0531
Название единицы хранения (англ.): Z-0531
Авторы: Заварзина Д.Г., ФИЦ Биотехнологии РАН, Институт микробиологии им. С.Н. Виноградского РАН, лаборатория реликтовых микробных сообществ, zavarzinatwo@mail.ru; uniqem@fbras.ru
Группа риска: 1
Типовой штамм: Да
Другие классификационные категории: Бактерии
Другие известные названия штамма: DSMZ 17813; ВКМ -В-2401
Биотехнологические свойства: наночастицы биогенного магнетита из-за биосовместимости, низкой токсичности и химической стабильности могут быть использованы в медицине, магнито-электронике и т.д.
Иные свойства: Впервые на примере этого штамма установлена возможность восстановления нерастворимых соединений железа при рН выше 9.0 в содовых озерах. что расширяет представление о биоразнообразии микробного мира и его возможностях. Диссимиляторный железоредуктор. Окисляет ацетат, используя в качестве акцептора электронов различные соединения Fe(III) или элементной серы. В качестве донора электронов использует помимо ацетата некоторые органические соединения. Восстановленными продуктами при росте на аморфной гидроокиси железа являются сидерит и магнетит. Не способен к брожению.Клетки содержат цитохром С. Способен к азотфиксации. Имеет наличие гена nifH и способен восстанавливать ацетилен в этилен в отсутствии иных источников азота кроме N2 в газовой фазе. Присутствие из антибиотиков в концентрации 100 мг/л ванкомицина и канамицина не оказывало влияния на рост, в то время как хлорамфеникол, стрептомицин, пенициллин, ампициллин, новобиоцин, бацитрацин или рифомицин подавляли развитие штамма
Дополнительная информация: поддерживается с 2005г., в лаборатории реликтовых микробных сообществ; таксон валидирован IJSEM в 2007 г.

Выделение штамма
Страна: Россия, Russian
Дата: 2005-04-10
Кем выделен: Заварзина Д.Г.
Кем идентифицирован: Заварзина Д.Г., Колганова Т.В., Булыгина Е.С., Турова Т.П.
Культивирование
pH: 0
Особые Требования: Анаэроб и среда для культивирования готовится с соблюдением анаэробной техники. Рост возможен в отсутствии восстановителей. Снижение Eh за счет добавления цистеина (0.3 г/л) увеличивает скорость роста и восстановление гидроокиси железа Облигатный алкалофил, не растет ниже рН 7.5 натронофил, Не нуждается в хлорид и карбонат-ионах. Галотолерант и растет с NaCL до 50 г/л в среде.
Методы и режимы: Жидкий азот при длительном хранении. При 4С в холодильнике в течение месяца
Статус штамма: типовая культура
Дополнительная информация: среда (г/л):KH2PO4 - 0.2; MgCl2 - 0.1; NH4Cl - 0.5; KCl - 0.2; NaCl ? 1.0; Na2CO3 ? 3.0; NaHCO3 -10; дрожжевой экстракт - 0.1; ацетат натрия ? 2; ЭДТА-Fe(III) ? 20мМ; раствор микроэлементов по Волину - 1мл/л. N2 (ос. чист.) в газ.фазе. рН 8.5-9.5; температура 35С. Рост 4-10 суток.
Молекулярно-генетические свойства
Идентификатор в GenBank: Содержание Г+Ц в ДНК 55.3 мол.% . Номера депонирования в ГенБанке гена 16S рРНК и nifH: DQ 309326 и DQ 660332
Идентификаторы в других базах данных: A SM82050 v1, IMG-taxon 2599185148 annotated assembly
Фенотип
Физиология
Тип питания: хемоорганотроф
Отношение к кислороду: анаэроб
Температура оптимальная: 18 - 39 ?С (опт.35?С)
Температура нижняя граница: 0
Температура верхняя граница: 0
pH оптимальная: 7.8 -10.0 (опт. 8.6)
Нижняя граница pH: 0
Верхняя граница pH: 0
Дополнительная информация: Способен к респираторному дыханию и восстанавливает аморфную гидроокись окисного железа (АГОЖ), ЭДТА-Fe(III), антрахинон-2,6-дисульфонат (хинон), Mn(IV) и So. Помимо ацетата окисляетпируват, оксалат, этанол, триптон, тартрат, аргинин, серин, пропионат и лактат. Для анаболизма нуждается в дрожжевом экстракте или витаминах.
Хранение
Среда: Только жидкие среды
Способ поддержания в UNIQEM: Да
Частота периодических пересевов: жидкий азот или периодические пересевы -1 раз в месяц
Таксономия
Царство: Bacteria
Филум: "Gracilicutes"
Класс: Proteobacteria
Подкласс: Дельта-подкласса
Порядок: Proteobacterales
Семейство: Geobacteraceae (Заварзина и др. 2006) и перенос позднее в Desulfuromonadaceae (Greene et al., 2009.IJSEM.V.59.P.781-785)
Род: Geoalkalibacter
Вид: ferrihydriticus